MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Anaplasma marginale str. Gypsy Plains genome

Total Repeats: 7734

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_022784	CT	3	6	316913	316918	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2002	NC_022784	GGCT	2	8	316987	316994	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2003	NC_022784	TGT	2	6	317002	317007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2004	NC_022784	TCT	3	9	317079	317087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2005	NC_022784	GCT	2	6	317201	317206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2006	NC_022784	TTGAC	2	10	317221	317230	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2007	NC_022784	TTG	2	6	317277	317282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2008	NC_022784	TTC	2	6	317348	317353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2009	NC_022784	CA	3	6	317456	317461	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2010	NC_022784	TTC	2	6	317517	317522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2011	NC_022784	CGC	2	6	317581	317586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2012	NC_022784	GTGCT	2	10	317659	317668	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2013	NC_022784	GAT	2	6	317694	317699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2014	NC_022784	CTG	2	6	317726	317731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2015	NC_022784	GCT	2	6	317742	317747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2016	NC_022784	TCG	2	6	317799	317804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2017	NC_022784	CAC	2	6	317828	317833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2018	NC_022784	TTG	2	6	317843	317848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2019	NC_022784	GC	3	6	317886	317891	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2020	NC_022784	TGG	2	6	317919	317924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2021	NC_022784	CCA	2	6	318031	318036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2022	NC_022784	TTC	2	6	318053	318058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2023	NC_022784	TACG	2	8	318092	318099	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2024	NC_022784	GC	3	6	318230	318235	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2025	NC_022784	CCA	2	6	318241	318246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2026	NC_022784	ACA	3	9	318295	318303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2027	NC_022784	TG	3	6	318310	318315	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2028	NC_022784	ACA	2	6	318465	318470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2029	NC_022784	TCA	2	6	318498	318503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2030	NC_022784	GT	3	6	318549	318554	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2031	NC_022784	CGTA	2	8	318556	318563	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2032	NC_022784	GC	3	6	318591	318596	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2033	NC_022784	CA	3	6	318749	318754	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2034	NC_022784	ATG	2	6	318801	318806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2035	NC_022784	TAC	2	6	318812	318817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2036	NC_022784	T	6	6	318828	318833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2037	NC_022784	CG	3	6	318924	318929	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2038	NC_022784	GA	3	6	318935	318940	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2039	NC_022784	TGG	2	6	319000	319005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2040	NC_022784	GT	3	6	319014	319019	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2041	NC_022784	TCC	2	6	319055	319060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2042	NC_022784	CAG	2	6	319061	319066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2043	NC_022784	CTT	2	6	319132	319137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2044	NC_022784	ATT	2	6	319268	319273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2045	NC_022784	TTC	2	6	319276	319281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2046	NC_022784	TCG	2	6	319317	319322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2047	NC_022784	TTG	2	6	319348	319353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2048	NC_022784	GC	3	6	319375	319380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2049	NC_022784	T	6	6	319535	319540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2050	NC_022784	TTGTA	2	10	319619	319628	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2051	NC_022784	GTG	2	6	319633	319638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2052	NC_022784	GCTT	2	8	319646	319653	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2053	NC_022784	CAG	2	6	319709	319714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2054	NC_022784	GCA	2	6	319750	319755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2055	NC_022784	TCG	2	6	319770	319775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2056	NC_022784	TCA	3	9	319785	319793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2057	NC_022784	ATG	2	6	319828	319833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2058	NC_022784	GGT	2	6	319851	319856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2059	NC_022784	ATC	2	6	319904	319909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2060	NC_022784	T	8	8	319935	319942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2061	NC_022784	CCAT	2	8	319993	320000	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2062	NC_022784	TGA	2	6	320009	320014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2063	NC_022784	ACG	2	6	320047	320052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2064	NC_022784	CG	3	6	320084	320089	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2065	NC_022784	AGG	2	6	320109	320114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2066	NC_022784	TAT	2	6	320138	320143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2067	NC_022784	ATT	2	6	320147	320152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2068	NC_022784	TGC	2	6	320211	320216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2069	NC_022784	TGT	2	6	320344	320349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2070	NC_022784	CAT	2	6	320355	320360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2072	NC_022784	GAT	2	6	320448	320453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2073	NC_022784	GAG	2	6	320462	320467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2074	NC_022784	TG	3	6	320469	320474	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2075	NC_022784	TGA	2	6	320589	320594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2076	NC_022784	T	6	6	320649	320654	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2077	NC_022784	TGG	2	6	320667	320672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2078	NC_022784	TTG	2	6	320677	320682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2079	NC_022784	T	6	6	320715	320720	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2082	NC_022784	TATG	2	8	320925	320932	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2083	NC_022784	TG	4	8	320949	320956	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2089	NC_022784	GCC	2	6	321200	321205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2090	NC_022784	CAT	2	6	321366	321371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2091	NC_022784	ACT	2	6	321380	321385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2092	NC_022784	CGAT	2	8	321393	321400	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2093	NC_022784	TTG	2	6	321406	321411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2094	NC_022784	CTG	2	6	321419	321424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2095	NC_022784	GC	3	6	321505	321510	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2096	NC_022784	GAT	2	6	321542	321547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2098	NC_022784	TTG	2	6	321610	321615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2099	NC_022784	CAT	2	6	321634	321639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2100	NC_022784	GATC	2	8	321704	321711	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2101	NC_022784	T	8	8	321720	321727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2102	NC_022784	CTC	2	6	321749	321754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2103	NC_022784	ATC	2	6	321798	321803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2104	NC_022784	TGT	2	6	321809	321814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2105	NC_022784	T	6	6	321844	321849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2106	NC_022784	GTT	2	6	321915	321920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2107	NC_022784	TCT	2	6	321955	321960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2108	NC_022784	GCG	2	6	321969	321974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2109	NC_022784	TAT	2	6	321982	321987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2110	NC_022784	CAA	2	6	322045	322050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2111	NC_022784	TGC	2	6	322128	322133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2112	NC_022784	GTT	2	6	322136	322141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2113	NC_022784	TCA	2	6	322224	322229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2114	NC_022784	CGG	2	6	322244	322249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2115	NC_022784	CTG	2	6	322271	322276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2116	NC_022784	ACATCT	2	12	322305	322316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2117	NC_022784	TGT	3	9	322319	322327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2118	NC_022784	ATC	2	6	322352	322357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2119	NC_022784	ATC	2	6	322403	322408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2120	NC_022784	CAT	2	6	322411	322416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2121	NC_022784	AT	3	6	322468	322473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2122	NC_022784	TGTGG	2	10	322554	322563	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
2123	NC_022784	TG	3	6	322631	322636	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2124	NC_022784	GCT	2	6	322653	322658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2126	NC_022784	TGC	2	6	322841	322846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2127	NC_022784	TTG	2	6	322848	322853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2128	NC_022784	GTG	2	6	322859	322864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2129	NC_022784	CTGGT	2	10	322916	322925	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2130	NC_022784	GT	3	6	322967	322972	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2131	NC_022784	GGA	2	6	323027	323032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2132	NC_022784	CAC	2	6	323068	323073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2133	NC_022784	TGTGT	2	10	323085	323094	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
2134	NC_022784	TTG	3	9	323100	323108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2135	NC_022784	GCA	2	6	323221	323226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2138	NC_022784	GT	4	8	323268	323275	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2139	NC_022784	GTT	2	6	323527	323532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2254	NC_022784	GCA	2	6	331544	331549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2256	NC_022784	TGA	2	6	331578	331583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2259	NC_022784	G	6	6	332328	332333	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2260	NC_022784	CTA	2	6	332337	332342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2404	NC_022784	GC	3	6	344573	344578	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2405	NC_022784	TTC	2	6	344587	344592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2407	NC_022784	TTA	2	6	344612	344617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2434	NC_022784	CTG	3	9	345933	345941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2436	NC_022784	CTT	2	6	346095	346100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2437	NC_022784	TCC	2	6	346109	346114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2443	NC_022784	GAG	2	6	346291	346296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2467	NC_022784	GC	3	6	347285	347290	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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